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植物翻譯控制腫瘤蛋白的分子結構特征與功能預測分析
翻譯控制腫瘤蛋白(The translationally controlled tumor protein,TCTP)是一類廣泛存在于動物、植物及酵母中的,在進化上高度保守、與其它任何蛋白家族均未顯示出明顯的序列同源性的蛋白.采用生物信息學的方法和工具對已在GenBank上注冊的擬南芥(Arabidopsis thaliana)、牽牛(Ipomoea nil)、草莓(Fragaria x ananassa)、橡膠樹(Heveabrasiliensis)、南瓜(Cucurbita maxima)、卷心菜(Brassica oleracea)的翻譯控制腫瘤蛋白的核苷酸及氨基酸序列進行分析,并對其組成成分、轉運肽、跨膜結構域、疏水性/親水性、蛋白質的二級及三級結構、分子系統進化關系等進行預測和分析.結果 表明,該基因的全長包括5'、3'非翻譯區和一個開放讀碼框,其編碼的蛋白是一個無跨膜結構域,不具轉運肽的親水性蛋白,包括一個β-折疊核心區和一個主要的α-螺旋區,不規則卷曲散布于整個蛋白質中,具有TCTP-1和TCTP-2兩個特征結構域.
作 者: 陳玉芹 王喆之 Chen Yuqin Wang Zhezhi 作者單位: 陜西師范大學生命科學學院,西安,710062 刊 名: 生物技術通報 PKU 英文刊名: BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年,卷(期): 2008 ""(2) 分類號: Q94 關鍵詞: 翻譯控制腫瘤蛋白(TCTP) 分子結構 功能預測 生物信息學【植物翻譯控制腫瘤蛋白的分子結構特征與功能預測分析】相關文章:
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