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植物查爾酮異構酶的生物信息學分析
采用生物信息學方法和工具對GenBank中的洋蔥、豌豆、番茄和茶等植物的黃酮類化合物合成關鍵酶查爾酮異構酶(CHI)的核酸和氨基酸序列進行了比對、分析和建模,進而對其分子結構、理化性質、亞細胞定位、蛋白轉運肽、跨膜結構域、疏水性、分子系統進化、蛋白質二級和三級結構等重要參數進行了預測和推理.結果表明:該類酶基因的全長包括5'、3'非翻譯區和一個開放閱讀框,無蛋白轉運肽,且定位于細胞質基質,是一個疏水性蛋白,二級結構均以隨機卷曲和α-螺旋為主要構件,洋蔥和豌豆的CHI三維建模成功.
作 者: 雷桅 鄒祥 向陽 湯紹虎 孫敏 LEI Wei ZOU Xiang XIANG Yang TANG Shao-hu SUN Min 作者單位: 雷桅,向陽,湯紹虎,孫敏,LEI Wei,XIANG Yang,TANG Shao-hu,SUN Min(西南大學,生命科學學院,三峽庫區生態環境教育部重點實驗室,重慶,400715)鄒祥,ZOU Xiang(西南大學藥學院,重慶,400715)
刊 名: 北方園藝 PKU 英文刊名: NORTHERN HORTICULTURE 年,卷(期): 2008 ""(2) 分類號: Q946.5 Q558 關鍵詞: 查爾酮異構酶 生物信息學 黃酮類化合物【植物查爾酮異構酶的生物信息學分析】相關文章:
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