5種鱘魚免疫球蛋白重鏈恒定區序列研究

為了探討幾種鱘魚免疫球蛋白(IgM)所包含的信息與其親緣和進化之間的關系, 分別對俄羅斯鱘(Acipenser. gueldenstaedtii)、小體鱘(A. ruthenus)、施氏鱘(A. schrenckii)、中華鱘(A. sinensis)和歐鰉(Huso huso)的IgM重鏈(IgH)恒定區進行了研究.采用RT-PCR的方法對IgH核酸序列進行了克隆, 通過軟件獲得了相應的IgH氨基酸序列.在分別對這5種鱘魚免疫球蛋白重鏈恒定區4個區(CH1～CH4)進行研究后發現, 其CH4區氨基酸序列相似性最高.通過對CH4區序列氨基酸變異期望值(Kaa), 物種分化時間(T)及物種間系統進化樹(Phylogenetic Tree)等參數的分析, 將克隆的5種鱘魚IgH恒定區序列與已發表的西伯利亞鱘同源序列比對(源于NCBI序列)后發現: 西伯利亞鱘與俄羅斯鱘、施氏鱘與歐鰉、小體鱘各構成一個分支, 并與中華鱘相對.實驗結果從體液免疫系統的演化這個角度, 反映了被研究的鱘魚物種間的分類地位、地理分布及進化關系之間的聯系.

作 者： 王荻 劉紅柏 WANG Di LIU Hong-Bai   作者單位： 王荻,WANG Di(中國水產科學研究院黑龍江水產研究所,哈爾濱,150070;東北林業大學野生動物資源學院,哈爾濱,150040)

劉紅柏,LIU Hong-Bai(中國水產科學研究院黑龍江水產研究所,哈爾濱,150070;東北農業大學博士后流動站,哈爾濱,150030) 

刊 名： 遺傳  ISTIC PKU 英文刊名： HEREDITAS(BEIJING)  年，卷(期)： 2006 28(10)  分類號： Q95  關鍵詞： 免疫球蛋白   重鏈   恒定區   鱘魚   進化關系  

【5種鱘魚免疫球蛋白重鏈恒定區序列研究】相關文章：

史氏鱘免疫球蛋白重鏈可變區序列及多樣性04-26

參數序列比對算法研究04-26

具有季節特征的水文時間序列預測模型研究04-26

基于WA-SVM的流域降雨序列預測研究及應用04-26

日污水流量序列的分形特征研究04-27

柔紅霉素與DNA作用的序列特異性研究04-26

插入序列在水稻白葉枯病菌防治上的研究進展04-27

淺析時間序列04-26

前導序列工程04-27

綠色供應鏈管理模式研究04-25