魚類DNA聚合酶δP12亞基cDNA克隆與序列分析

從斜帶石斑魚(Epinephelus coioides)白細(xì)胞cDNA文庫(kù)隨機(jī)挑選克隆,測(cè)定表達(dá)序列標(biāo)簽(ESTs),利用BLASTX程序與GenBank中的序列進(jìn)行比較,得到了1個(gè)cDNA,其編碼蛋白質(zhì)與人類DNA聚合酶δ(polδ)的P12亞基有47.7%的同源性,推測(cè)它為斜帶石斑魚polδ的12 kD小亞基的cDNA,所編碼的蛋白質(zhì)命名為P12.該cDNA全長(zhǎng)619 bp,含1個(gè)330 bp的開放閱讀框,編碼109個(gè)氨基酸殘基的蛋白質(zhì).序列對(duì)比表明,斜帶石斑魚的氨基酸序列與人、大鼠、小鼠、擬南芥和裂殖酵母的polδ小亞基有同源性,同時(shí)與斑馬魚EST CK680540的編碼序列有66.6%的同源性.用RT-PCR檢測(cè)該基因在石斑魚各組織的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)在腮、肝、脾、全血、胃和后腎有表達(dá),而在腸、心臟、腦和頭腎未檢測(cè)到.[中國(guó)水產(chǎn)科學(xué),2006,13(3):466-470]

作 者： 殷志新 黃仙德 何建國(guó) YIN Zhi-xin HUANG Xian-de HE Jian-guo   作者單位： 中山大學(xué),生命科學(xué)學(xué)院,廣東,廣州,510275  刊 名： 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF FISHERY SCIENCES OF CHINA  年，卷(期)： 2006 13(3)  分類號(hào)： Q75  關(guān)鍵詞： DNA聚合酶δ(polδ)   P12亞基   斜帶石斑魚   RT-PCR  

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