基于近似熵的偽氨基酸組成預測蛋白質亞核定位

了解真核細胞中細胞核內蛋白質的定位情況對于新發現蛋白質的功能注釋具有重要意義.隨著蛋白質數據庫中蛋白質序列數量的急速增加,采用計算方法來預測蛋白質亞核定位已經成為蛋白質科學領域研究的熱點.根據Chou提出的偽氨基酸組成離散模型,提出了一種新的蛋白質亞核定位預測方法.計算蛋白質序列的近似熵作為附加特征構建偽氨基酸組成,表示蛋白質序列特征,AdaBoost分類算法作為預測工具.與已報道的亞核定位預測方法的性能相比,這種方法具有更高的準確率.

作 者： 張同亮 丁永生 顧全 孫登寬 ZHANG Tong-liang DING Yong-sheng GU Quan SUN Deng-kuan   作者單位： 張同亮,顧全,孫登寬,ZHANG Tong-liang,GU Quan,SUN Deng-kuan(東華大學信息科學與技術學院,上海,201620)

丁永生,DING Yong-sheng(東華大學信息科學與技術學院,上海,201620;數字化紡織服裝技術教育部工程研究中心,上海,201620) 

刊 名： 生物物理學報  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BIOPHYSICA SINICA  年，卷(期)： 2008 24(3)  分類號： O61  關鍵詞： 蛋白質亞核定位   偽氨基酸組成   近似熵   AclaBoost分類器  

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