真雙子葉基部類群十種植物的CHS基因家族成員分析

用PCR方法從目前極少被報道的真雙子葉基部類群10種植物的總DNA中擴增出CHS基因外顯子2的部分序列進行分析,經克隆后測序,共得到26個不同的片段.分析表明,所有序列具有較高的同源性(＞ 70%),每種植物有2～4個不同的拷貝,在金魚藻中發現有一個拷貝(CedeCHS3)含有一段長29個堿基的缺失,可能已失去了該基因的功能,而來自銀樺的GrroCHS8拷貝具有較多活性位點的變異,可能具有了新的功能.在對堿基含量的分析中表明,只有來自雀舌黃楊的序列有一定的GC偏好,特別是第三位的GC含量達70%以上.用貝葉斯法、最大簡約法和鄰接法構建的CHS基因的分子系統樹均由3個主要分支構成,其中一個分支由來自金魚藻的4個序列聚在一起構成了sulfamily Ⅱ,來自昆欄樹的2個序列聚在一起網接于subfamilyⅢ中;來自獨葉草的3個序列分散于同一亞家族(subfamily Ⅰ)的不同分支中;而多數種的序列分散在相距較遠的兩個分支中,構成了兩個主要的亞家族subfamilyⅠ、subfamily Ⅲ.從所建分子系統樹看真雙子葉基部類群植物的CHS基因家族成員來源于該類群形成前的兩個祖先拷貝,在不同植物這兩個祖先拷貝經歷了不同的進化過程,這些進化上的差異可能與不同植物的生活習性及生存環境的多樣性相關.

作 者： 楊俊波 楊漢奇 李德銖 李洪濤 YANG Jun-Bo YANG Han-Qi LI De-Zhu LI Hong-Tao   作者單位： 中國科學院昆明植物研究所生物多樣性和生物地理學重點實驗室,云南,昆明,650204  刊 名： 云南植物研究  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BOTANICA YUNNANICA  年，卷(期)： 2006 28(4)  分類號： Q945  關鍵詞： 真雙子葉基部類群   查爾酮合酶基因家族   進化   重復  

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