基于β-微管蛋白基因部分序列探討靈芝屬菌株的親緣關系

PCR分別擴增了38個靈芝屬菌株的β-微管蛋白基因片段,并對PCR產物進行序列測定,得到419bp的一段核苷酸系列.根據MEGA 2.1軟件中的neighbour-joining methods對上述序列進行聚類分析,結果所有供試菌株被分成9個聚類組.中國栽培靈芝菌株分布于6個聚類組,其中樹舌亞屬、紫芝組的菌株各自聚成一組,靈芝組的菌株分成四組,但大部分靈芝組菌株均聚于同一組, 這表明樹舌亞屬、紫芝組和靈芝組間的遺傳差異較大,靈芝組內雖然存在著一定的遺傳差異,但總體上親緣關系比較近,遺傳多樣性并不豐富.同時,序列分析的結果顯示,β-tubulin基因序列在第三位密碼子和內含子部位有高的堿基替換率,這些變異提供了豐富的系統發育信息,提示β-tubulin基因適合于靈芝屬菌株的親緣關系研究.

作 者： 蘇春麗 唐傳紅 張勁松 潘迎捷 SU Chun-Li TANG Chuan-Hong ZHANG Jing-Song PAN Ying-Jie   作者單位： 蘇春麗,SU Chun-Li(南京農業大學生命科學學院微生物系,南京,210095;上海農業科學院食用菌研究所,上海,201106)

唐傳紅,張勁松,TANG Chuan-Hong,ZHANG Jing-Song(上海農業科學院食用菌研究所,上海,201106)

潘迎捷,PAN Ying-Jie(上海水產大學,食品科學學院,上海,200090) 

刊 名： 菌物學報  ISTIC PKU 英文刊名： MYCOSYSTEMA  年，卷(期)： 2006 25(3)  分類號： Q94  關鍵詞： 序列分析   neighbour-joining methods   聚類分析   遺傳多樣性  

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