環境微生物不依賴于培養的基因組學研究及應用

微生物在生物圈中分布廣泛,并且在地球物質循環中占有重要地位,但是約99%的微生物目前還不能通過傳統的培養方法得到純培養物(即未培養微生物),給這些未培養微生物的研究帶來很大的困難.隨著分子生物學的快速發展及其在微生物研究中的廣泛運用,促進了以環境中未培養微生物為研究對象的新興學科--環境基因組學的產生和發展.在不進行相關微生物培養分離的情況下,通過從環境樣品中直接提取獲得所有微小生物的全部遺傳物質,并構建環境基因組文庫;進一步利用功能基因組學研究策略,從文庫中尋找編碼產生新的有生物活性產物的基因;通過對系統發育相關錨定位點基因序列分析,從而確定特定生態環境體系中未培養微生物的種類結構組成及進化地位,并最終重建該體系中微生物群體的基本物質循環模式.此外,環境基因組學也可以在對未培養微生物生理生化特性深入了解的基礎上,建立發展合適的培養體系,最終獲得某些特定微生物的純培養物.對環境基因組的構建及相關分析研究策略的進展進行了綜述;同時介紹了其微生物分類及在生態學研究中的應用.

作 者： 王鳳超 劉巍峰 陳冠軍 劉春朝 WANG Feng-chao LIU Wei-feng CHEN Guan-jun LIU Chun-zhao   作者單位： 王鳳超,劉巍峰,陳冠軍,WANG Feng-chao,LIU Wei-feng,CHEN Guan-jun(山東大學生命科學學院微生物技術國家重點實驗室,濟南,250100)

劉春朝,LIU Chun-zhao(中國科學院過程工程研究所生化工程國家重點實驗室,北京,100080) 

刊 名： 中國生物工程雜志  ISTIC PKU 英文刊名： CHINA BIOTECHNOLOGY  年，卷(期)： 2006 26(9)  分類號： Q93  關鍵詞： 未培養微生物   環境基因組學   基因組文庫   功能分析篩選   微生物生態  

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