蛋白質(zhì)序列中的關(guān)聯(lián)規(guī)則發(fā)現(xiàn)及其應(yīng)用

隨著蛋白質(zhì)序列-結(jié)構(gòu)分析中使用的機(jī)器學(xué)習(xí)算法越來(lái)越復(fù)雜,其結(jié)果的解釋和發(fā)現(xiàn)過(guò)程也隨之復(fù)雜化,因此有必要尋找簡(jiǎn)單且理論上可靠的方法.通過(guò)引入原理簡(jiǎn)單、理論可靠、結(jié)果具有很強(qiáng)實(shí)際意義的關(guān)聯(lián)規(guī)則發(fā)現(xiàn)算法,找到了蛋白質(zhì)序列中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的模式.結(jié)合實(shí)例演示了如何將這些模式應(yīng)用于蛋白質(zhì)序列分析中,如保守區(qū)域發(fā)現(xiàn)、二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)等.同時(shí)根據(jù)這些結(jié)果構(gòu)建了一個(gè)二級(jí)結(jié)構(gòu)規(guī)則庫(kù)和一種簡(jiǎn)單的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)算法,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,約81%的二級(jí)結(jié)構(gòu)可以由至少一條關(guān)聯(lián)規(guī)則預(yù)測(cè)得到.

作 者：   作者單位：   刊 名： 生物物理學(xué)報(bào)  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BIOPHYSICA SINICA  年，卷(期)： 2006 22(3)  分類號(hào)： Q5  關(guān)鍵詞： 蛋白質(zhì)序列   關(guān)聯(lián)規(guī)則   二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)   模式發(fā)現(xiàn)  

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